Осенью 1939 года в окрестностях будущего города Сибай было открыто Ново-Сибайское медно-цинковое колчеданное месторождении. Весной 1941 года из Баймака в Сибай переехала геологоразведочная контора, которая с тех пор стала называться Сибайской геологоразведочной партией. Среди первооткрывателей Сибайского месторождения был Почетный гражданин нашего города И.Ф.Мутаев, а за его открытие, изучение и разведку геологи С.Н.Иванов и К.Д.Субботин были удостоены Государственной премии СССР.

С началом строительства Башкирского медно-серного комбината геологоразведочные работы стали вестись планомерно и ускоренными темпами. К концу 70-х годов усилиями геологов в юго-восточной части Республики Башкортостан была создана мощная минерально-сырьевая база медных месторождений, включающая три известных крупных месторождения: Подольское, Юбилейное и Октябрьское. За открытие и разведку этих месторождений Ю.А.Болотин, У.Ю.Давлетбаев, Г.Ю.Мазитов, В.В.Воробьев, В.М.Попов, Г.К.Долматов, Н.В.Матвеев были удостоены звания лауреатов Государственной премии СССР.

В.1980 году для решения приоритетных государственных задач по дальнейшему наращиванию минерально-сырьевой базе страны на базе Сибайской, Баймакской, Переволочанской (Бурибаевской) экспедиций была создана одна мощная Юго-Восточная геолого-разведочная экспедиция, начальником которой был назначен Кораблинов В.В, главным геологом Болотин Ю.А,( с 1990 года по настоящее время главный геолог Татарко Н.И.), главным инженером  - Самофалов Ф.И.

Это позволило более интенсивно проводить поисковые работы с использованием самых передовых методов и технологий. Работы увенчались открытием новых месторождений: Северо-Подольского(1983г), шестой залежи Юбилейного месторождения (1981-1985гг), восточно-Подольского(1987),Вишневского(1988г).

Политические и экономические преобразования в стране в начале 90-х годов прошлого века негативно отразились и на проведении геологоразведочных работ. Объемы государственного заказа упали в 10 раз. Это предопределило перестройку деятельности экспедиции. С 1994 года Юго-Восточная ГРЭ стала акционерным обществом с наименованием – Сибайский филиал ОАО «Башкиргеология». Геологоразведочные  работы стали проводится не только на медь и золото, но на другие виды полезных ископаемых для решения текущих нужд предприятий . Это прежде всего: поиски разведка подземных питьевых и минеральных вод, строительных материалов(облицовочный камень, песчано-гравийные смеси др.), агрохимическое сырье; большой объем инженерно-геологических изысканий под строительство поселков, шахтных стволов, изучения оползневых явлений и др.В это время важным моментом для предприятия является его зарубежная деятельность и прежде всего в странах: Перу, Индонезия, Бирма и др. 1991г по настоящее время было выявлено и разведано более 15-и месторождений различного вида минерального сырья . В 2001 году за значительный вклад в создание минерально- сырьевой базы юго-восточной части Республики Башкортостан директор Сибайского филиала ОАО «Башкиргеология» Самофалов Ф.И и главный геолог Татарко Н.И были удостоены звания «Заслуженный геолог Республики Башкортостан»

Наряду с выполнением геологоразведочных работ, которые в общем объеме составляют 90-95%, в филиале были созданы и успешно функционируют нетрадиционные производства прежде всего: цех по изготовлению художественных изделий из камня и цех художественной ковки.

В последние годы Сибайский филиал ОАО «Башкиргеология» благодаря труду рабочих и профессионализму специалистов успешно участвует в федеральных конкурсах геологоразведочных работ в рамках минерально-сырьевых программ Российской Федерации, что позволяет предприятию сохранить свой геологический потенциал.